基因组denovo测序
基因组denovo测序即从头测序，是不依赖于任何参考序列对某物种进行测序，通过生物信息学分析手段进行拼接、组装，从而获得该物种全基因序列图谱。一个物种基因组序列图谱的完成，将带动该物种一系列后续研究。
多态性标记开发(SNP 分子鉴定 近等基因系）
高通量开发不同个体间的SNP、InDel标记，实现全基因组均匀覆盖，特别适合近等基因系、单片段代换系中相应片段的鉴定。
全基因组甲基化测序
测序可精确到单个碱基的甲基化，能得到全基因组的甲基化位点信息，可用于全基因组DNA甲基化图谱制作;疾病关联分析;基因调控分析;疾病的甲基化标志物等。
长链非编码RNA测序（lncRNA-seq）
长链非编码RNAs（long non-coding RNAs，lncRNAs）是一类长度大于200 nt且不编码蛋白质的RNAs（不含rRNA）
简化甲基化测序
RRBS(Reduced representation bisulfite sequencing) ，即简并代表性亚硫酸氢盐测序技术，仅对高CpG区域进行测序。